Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms