Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nek9Q8K1R7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nek9Q8K1R7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nek9Q8K1R7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms