Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms