Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms