Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms