Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms