Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms