Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc28Q80XJ3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc28Q80XJ3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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