Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms