Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnih3Q6ZWS4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnih3Q6ZWS4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms