Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup98Q6PFD9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms