Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vstm2lQ6PDS0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vstm2lQ6PDS0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms