Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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