Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurod1Q60867 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms