Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cnot7Q60809 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot7Q60809 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms