Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms