Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn3Q60764 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms