Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bod1Q5SQY2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms