Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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