Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms