Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5935Q497S0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5935Q497S0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms