Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms