Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms