Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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