Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms