Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3UPC7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms