Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms