Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b2Q3UJB0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms