Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms