Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms