Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud5Q3U2S4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Otud5Q3U2S4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Otud5Q3U2S4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud5Q3U2S4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms