Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
InipQ3TXT3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms