Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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