Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Shroom4Q1W617 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shroom4Q1W617 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms