Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms