Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrriq1Q0P5X1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrriq1Q0P5X1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms