Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms