Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms