Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Thbs3Q05895 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms