Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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