Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff2Q03404 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff2Q03404 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tff2Q03404 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff2Q03404 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff2Q03404 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff2Q03404 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff2Q03404 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms