Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms