Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AlkP97793 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AlkP97793 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AlkP97793 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AlkP97793 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms