Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfixP70257 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfixP70257 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NfixP70257 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfixP70257 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfixP70257 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfixP70257 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfixP70257 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfixP70257 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfixP70257 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfixP70257 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfixP70257 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfixP70257 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfixP70257 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfixP70257 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfixP70257 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfixP70257 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfixP70257 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfixP70257 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms