Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms