Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CirbpP60824 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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