Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms