Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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