Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa9P50707 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms