Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn1bP46414 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms